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Analisi Legionella Italia

Microbiologia

Gene mip (Macrophage Infectivity Potentiator)(mip)

Gene specifico di Legionella codificante per una peptidil-prolil isomerasi; bersaglio molecolare standard per identificazione e tipizzazione.

Specie, sierogruppi, ospiti protozoari e tecniche molecolari per identificare e tipizzare Legionella.

Il gene mip codifica per una proteina di 24 kDa essenziale per l'invasione e la sopravvivenza intracellulare di Legionella nei macrofagi alveolari. È universalmente presente nel genere Legionella e altamente conservato, con sufficiente variabilità inter-specie da consentirne l'uso come marker filogenetico.

Approfondimento

DETTAGLIO TECNICO

Il sequenziamento di mip è la tecnica di riferimento per identificazione di specie nei laboratori di Legionella, raccomandata dal protocollo ESGLI. La banca dati pubblica ospita oltre 4000 sequenze di riferimento. Il gene è inoltre usato come target nei kit qPCR Legionella spp. presenti sul mercato.

In pratica

GENE MIP (MACROPHAGE INFECTIVITY POTENTIATOR) NELLA GESTIONE DELL'IMPIANTO

Il gene mip entra nella vita di un gestore quasi solo indirettamente, leggendo un referto di PCR o un rapporto di identificazione. Molti kit qPCR per Legionella spp. lo usano come bersaglio, e il suo sequenziamento permette di attribuire una specie a colonie che il laboratorio non riesce a classificare con i test di routine. Il dato conta in due situazioni: un'indagine epidemiologica dopo un caso e la necessità di capire se positività ripetute derivano sempre dalla stessa specie. Un ospedale con isolati di Legionella non pneumophila in più reparti può chiedere al laboratorio di riferimento il sequenziamento di mip, per stabilire se si tratta di una sola specie diffusa nella rete o di colonizzazioni diverse.

Errori ed equivoci frequenti

  • Interpretare una PCR positiva sul gene mip come prova di batteri vivi: la tecnica rileva DNA, anche di cellule morte dopo una bonifica.
  • Confondere identificazione di specie e tipizzazione epidemiologica: il sequenziamento di mip attribuisce la specie, ma non sostituisce metodi come la Sequence-Based Typing.
Glossario

SINONIMI E VARIANTI

  • macrophage infectivity potentiator
Domande frequenti

FAQ: GENE MIP (MACROPHAGE INFECTIVITY POTENTIATOR)

A cosa serve il gene mip nelle analisi della legionella?
È un gene presente in tutto il genere Legionella, abbastanza conservato da essere riconosciuto e abbastanza variabile da distinguere le specie. Viene quindi usato come bersaglio nei test PCR e come base per il sequenziamento che identifica la specie di un isolato. Nei referti ambientali compare soprattutto nelle analisi molecolari di supporto.
Una PCR positiva al gene mip vale come analisi ufficiale?
La PCR fornisce un risultato rapido e utile per decisioni preliminari, ma non sostituisce la conta colturale in UFC/L secondo UNI EN ISO 11731:2017, a cui si riferiscono le soglie delle Linee guida 2015. Un risultato molecolare positivo andrebbe quindi confermato con la coltura prima di trarre conclusioni definitive.
Fonti

RIFERIMENTI ISTITUZIONALI

  • Ratcliff RM et al., J Clin Microbiol 1998 — Sequence-based classification scheme for the genus Legionella using the mip gene
  • ESGLI mip sequence database
Glossario

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